带冷冻功能的微量离心机让温度敏感样品的处理从容了许多，赛默飞micro21R微量冷冻离心机就属于这类设备，腔体制冷能在离心过程中维持低温，酶、核酸一类样品的活性因此得到保护。冷冻机型比常温机型多了制冷系统，使用上的讲究也相应多了一些，集中在预冷、转子管理和除霜三件事上。 预冷环节要给足时间。开机后设定目标温度，让设备空载降温到设定值再放样品，腔体从室温降到低温需要一段时间，具体长短与环境温度和设定值有关。着急实验时直接把样品放进尚未降温的腔体，实际离心温度远高于显示值，样品经历的温度过程与预期不符，实验重复性就打折扣。建议把预冷纳入实验排程，开机后先去准备试剂，两不耽误。
转子使用方面，冷冻机型常配多种转子，更换转子时注意安装到位并按说明书要求锁紧。不同转子的允许转速不同，同一转子适配不同样品管时，允许转速还与管件类型有关，超速使用有安全隐患。转子每次使用前目视检查有无裂纹、腐蚀和变形，长期使用后按厂家给的寿命周期安排更换或检测。转子从冷腔取出后表面会结露，擦干后再存放，带水存放会加速锈蚀。多个转子轮换使用能延长单个转子的寿命，也方便错峰安排样品。
腔壁和蒸发器会积累霜层，霜层过厚影响制冷效率，按使用频率定期执行除霜程序，除霜前取出转子，除霜后擦干腔体。样品管破裂后的清理流程与常温机型一致，区别在于低温下液体冻结，需等温度回升后再清理残液。门封条检查密封性，发现老化开裂及时更换，门封不严会让冷量流失、结霜加重。
运行管理上，给设备接独立电源回路，避免与波动的负载共用插座；记录每次较长时间运行的温度设定与实际显示值，作为制冷系统状态的参考；每年安排一次厂家巡检，检查制冷剂压力和压缩机运行状况。低温离心设备的寿命和可靠性，就是靠这些按部就班的维护换来的。还有一点容易被忽略：同一批样品需要在固定温度下离心时，提前把转子预冷到位再装管，比依赖腔体降温更稳妥，转子温度直接影响样品实际经历的温度历程，做酶活测定的实验对这一点尤其敏感。多花几分钟预冷，数据的可信度就多一分保障。
